水-硅油双相体系对多环芳烃降解菌的筛选及鉴定
来源:要发发知识网
生态环境学报2010,19(8):1887—1892 http://www.jeesci.com E.mail:editor ̄ieesci.tom 水一硅油双相体系对多环芳烃降解茵的筛选及鉴定 刘芳,梁金松,李季 中国农业大学资源与环境学院,北京100193 摘要:选用水.硅油双相体系驯化筛选降解多环芳烃的优势菌株。筛选体系为:50 mL无机盐溶液+10 mL硅油。从74瓶富 集液中,对降解效果明显的富集液进行多环芳烃降解率的液相色谱定量测定。对蒽的降解率最高为45%;对荧蒽的降解率 最高为99%,几乎全部降解,对苯并[a]芘的降解率为27%。筛选到一株能够高效降解蒽、菲、芘、荧蒽的菌株,编号LD29, 鉴定结果为矢野口鞘氨醇杆菌LD29(Sphingobiumyanoikuyae LD29 o富集液Y12对5种多环芳烃的降解效果同样很明显。 关键词:水.硅油;多环芳烃;降解;筛选 中图分类号:X172 文献标识码:A 文章编号:1674—5906(2010)08—1887-06 多环芳烃(PAHs)是一类在自然界广泛存在的 难降解的有机污染物,一些微生物经过驯化,能以 其作为碳源生长、繁殖。通:过人工富集、培养,可 分离出能降解PAHs的微生物Il之J。但这类物质通常 蒽、荧蒽、苯并[a]芘、乙腈均为色谱纯,购自 Sigma.Aldrich公司,其他试剂为分析纯。硅油密度 为0.96 g.cm一。 1.2实验方法 要求在有其他碳源或能源物质共存的条件下才能 部分或全部降解(即共代谢作用),且大多数微生物 对有机物的降解作用主要在水相中进行,难溶于水 的有机物的降解不易进行或只能在界面进行,这就 使PAHs降解菌的筛选和分离十分困难l3J。利用相 似相溶的原理,可以降低水相中多环芳烃的浓度, 1.2.1培养基 细菌培养基:牛肉膏3 g,蛋白胨5 g,琼脂l8 g,水1 000 mL,pH 7.0~7.2。固体加1.5%~2%左右 琼脂 基本无机盐培养基:MgSO4‘7 H20 0.2 g, KH2PO4 1.0 g,K2HPO4 1.0 g,FeC13或FeSO40.05 并提供两相交互界面的筛选条件。目前常用的有机 溶剂有:硅油、2,2,4,4,6,8,8一七甲基壬 烷、癸烷、十二烷、十六烷、十八烷、二乙基癸二 酸酯、十一醇、油醇等。陶雪琴等l4J就采用水.硅油 g,CaC12 0.02 g,NH4NO3 1.0 g,NaC1 0.5 g,水1 000 mL,pH 7.5。 1.2.2水一硅油双相体系 双相体系筛选出了对多环芳烃菲有很好降解效果 的混合菌。 目前多环芳烃降解菌的驯化方法主要是传统 的单一水相体系无机盐筛选方法 J。筛选周期长, 筛选出的菌种不多L2J,而且大部分都是针对单一、 低环的多环芳烃有降解效果I6]。自然界中多环芳烃 用丙酮分别配制蒽、荧蒽、苯并[a】芘溶液,之 后0.22 um的微孔滤膜过滤除菌,取一定量的上述 溶液置于灭菌的三角瓶中,待有机溶剂挥发后加入 灭菌的基本无机盐培养基,文中如未说明,蒽、荧 蒽的终质量浓度为100 mg・L~,苯并[a]芘的终质量 浓度为10 mg-L~。 本实验采用的水一硅油双向体系设置如下: 50 mL无机盐溶液+10 mL硅油; 降解菌的富集设以下4个处理:180 r・min~, 30℃,避光培养。 处理1:蒽(100 mg・L )(N1一N17); 处理2:荧蒽(100 mg・L。)(Y1一Y17); 处理3:苯并[a]芘(1O mg・L )(131一B17); 处理4:蒽+荧蒽+苯并[a]芘(33_3 mg・L~+33_3 mg‘L +3.33 mg‘L )(H1-H17)17个样品,共68瓶, 水一硅油双相体系见图1。 都是相伴存在的,如果只能降解其中一种多环芳 烃,不利于在生产实践中的应用。硅油就是一种很 好的疏水性有机溶剂,不仅对热稳定、难以光解、 而且不能生物降解。微生物在两相界面或水相中利 用PAHs作为唯一碳源,既能为微生物生长提供足 够的营养,又不抑制微生物的活性【7】。本实验利用 水一硅油双向体系筛选出的降解体系能够降解五种 多环芳烃,且降解效果显著。应用前景广阔。 1材料与方法 1.1 目标污染物 基金项目: 广东省教育部产学研结合项目(2007B090400101) 作者简介: 刘芳(1981年生),女,博士,研究方向为环境微生物。E—mail:tbliufangcau@163.corn 通讯作者:李季(1965年生),男,研究方向为固体废弃物处理。E.mail:tbliufang1980@sina corn 收稿日期: 2010—06—10 1888 生态环境学报第19卷第8期(2010年8月) 法如F: 从富集液中吸取1 mL混合菌液,加入含有多 环芳烃的无机盐溶液中,浓度与富集液中的多环芳 烃浓度相同,5 d后,进行液相色谱的定量测定。 均设3次重复。 1.2.4 PAl-Is残留量测定 图1水.硅油双相体系 Fig.1 Water—silicone oil biphasic system 第一代富集液为土样富集液,每瓶加入5 g土 样。驯化周期为14 d。处理4在第二代富集之后, 其中2瓶富集液,即:H2、H3出现了明显颜色变 化,硅油相粉红色,水相有的为黄色,有的为粉红 色。于是,对有颜色变化的多环芳烃混合富集液增 加了3个处理 j(6瓶,共74瓶)。 处理l:蒽+荧蒽(50 mg・L~+50 mg・L ); 处理2:蒽+苯并芘(50 mg・L +5 mg・L ); 处理3:荧蒽+苯并芘(50 mg・L +5 mg・L ); 编号分别为:H2(Y+N)fN+B)(Y+B);H3(Y+N) (N+B)(Y+B) 培养结束,向每个试管中加10 mL乙酸乙酯, 涡旋30 S。静置待水层与有机层分离,用移液管从 上层有机层取1 mL乙酸乙酯到干净的棕色玻璃瓶。 55℃下用氮气流轻轻吹乙酸乙酯至完全挥发,再加 入2 mL乙腈溶解结晶的PAHs。用0.22 I.tm孔径的 有机相滤膜过滤乙腈溶液到另一干净的棕色玻璃 瓶中,盖上盖。用安捷伦LC1200高效液相色谱仪 测定多环芳烃残留率。采用Venusil MP C18柱(5 帅粒径,4 1TIITI直径,长度250 rnlTl,天津博纳艾 杰尔科技),流动相为乙腈和水。前5 min内采用 60%乙腈洗脱,在接下来的25 min,乙腈梯度洗脱 到100%,100%洗脱保持5 min,共计35 min。 1.2.5测序和分析 序列的同源性在GenBank数据库中使用 BLAST工具进行比较,然后用CLUSTALX 1.8进 行比对,然后用MEGA 3.1构建目录树。LD29的 测序和理化试验由中国科学院微生物所完成。 2结果与分析 2.1 葸、荧蒽、苯并【a】芘降解菌(单菌株)的筛 选 考虑到蒽、荧蒽、苯并[a]芘多环芳烃在水中的 溶解度都比较低,要筛选出对多环芳烃,尤其是4 环以上的高环多环芳烃的高效降解菌株,必须选择 一共驯化培养8代,每代为7 d。因摇床温度变 化,个别驯化周期有调整,最多为10 d,见表1。 1.2.3多环芳烃降解率的测定 本实验采用水一硅油双相体系进行多环芳烃降 解菌的筛选。从直观来看,有颜色变化的富集液中 有高效多环芳烃降解菌的存在[4]。实验共有富集液 74瓶,由于样品太多,还需要对有降解效果的混合 菌液进行定量筛选,对降解效果明显的混合菌进行 分离实验。以期筛选到高效降解的单株菌。具体做 个好的驯化方法。本实验主要选用水一硅油双相体 系驯化筛选降解多环芳烃的优势菌株。经过最初通 过对土样的驯化培养14 d后,驯化结果见表2,驯 化过程中的摇瓶颜色变化见图2。 2.2蒽、荧蒽、苯并芘【a】降解菌的分离 从74瓶富集液中,对降解效果明显的富集液 进行多环芳烃降解率的液相色谱定量测定,为下一 步降解菌的分离实验提供数据指导。 表1 水一硅油双相体系驯化筛选条件 Tab l The screening condition in water-silicone oil biphasic system 因摇床温度变化,个别驯化周期有调整,最多为10 d 刘芳等:水一硅油双相体系对多环芳烃降解菌的筛选及鉴定 表2水一硅油双相体系中以蒽、荧蒽、苯并【a1芘 为唯一碳源驯化培养的摇瓶记录 Tab 2 The results ofmixed cultures from diferent site using Anthracene Fluoranthene Benzo[a]pyrene as sole carbon source in water-silicon oil biphasic system 驯化碳源 摇瓶培养观察结果 垂霉 I I I I●・● 1。。 8。 s。 2。 0 图4不同富集jk11甍龛 紧 的降解率 Fig.4 The biodegradation rate of lfuoranthene by bacteria rom fdifferent mixed cultures 40 圈2水.硅油双相体系中以蒽、荧蒽、苯并【a】芘为唯一碳源驯化培养 的摇瓶颜色变化 Fig.2 The color change of mixed cultures from diferent site using An— 30 thracene Fluoranthene Benz0[a】pyrene as sole carbon source in wa- ter-silicon 0|l biphasic system 譬20 世 10 0 H3 我们选取了N2、N3、N14、N16、Y2、Y11、 YI2、H2(Y+B)、H3(Y+B)、H2(N+Y)、H3(N+Y)、 ・ Hl4 混合菌系 图5不同富集液中混合菌对苯并【a]的降解率 Fig.5 The biodegradation rate ofbenzo[a]pyrene by bacteria from diferent mixed cultures H2、H3、H14共l4瓶富集液进行液相色谱的定量 测定,使下一步的混合菌分离实验更为合理,也能 相应减轻混合菌的分离工作,为筛选到高效降解多 环芳烃的菌株节省时间,提高效率。同时,也为降 解菌株的降解实验做充分的准备。蒽的降解率见图 3,荧蒽的降解率见图4,苯并[a]芘的降解率见图5。 从图3中可以看出,H2、H3对于蒽的降解率 最低,分别为21%和36%;N2、N3、N14、N16、 H3(N+Y)对于蒽的降解率很相近,为45%左右。H2、 H3为混合3种多环芳烃混合溶液,包括蒽、荧蒽 和苯并[a]芘,N2、N3、N14、N16为以蒽为唯一碳 源的富集液,H3(N+Y)富集液中包括蒽和荧葸。H2、 H3的降解率低,可能是富集液中高环多环芳烃的 毒性作用,存在4环的荧蒽和5环的苯并[a]芘,也 可能是因为没有高效降解蒽菌株的存在。H3 +Y) 的降解率略低,可能是因为荧蒽的存在对于蒽的降 解有一定的阻碍作用,4环荧葸对于微生物的毒害 作用要大于3环的蒽。可以初步判断,H2、H3、 N2、N3、N14、N16、H3 +Y)这7瓶富集液中存 在高效降解蒽的菌株,可以作为蒽降解菌分离的混 合菌液。 从图4中可以看出,Y2、Y1l对于荧蒽的降解 率最低,分别为32%和38%;H3对于荧蒽的降解 率最高,为99%,几乎全部降解。Y12、H2(N+Y)、 H3(N+Y)、H2(Y+B)对于荧蒽的降解率也很高,分 别为87%、86%、93%、8I%。H14与H3(Y+B)对 生态环境学报第19卷第8期(2010年8月) 于荧蒽的降解率很相近,分别为58%和60%。H3、 H14为混合三种多环芳烃混合溶液,包括蒽、荧蒽 和苯并『a]芘,Y2、Y11、Y12为以荧蒽为唯一碳源 的富集液,H2(N+Y)、H3(N+Y)富集液中包括蒽和 荧蒽,H2(B+Y)、H3(B+Y)富集液中包括荧蒽和苯 并[a]芘。可以初步判断,Y2、Y11富集液中不存在 高效降解荧蒽的菌株,其余7瓶富集液中存在高效 降解荧蒽葸的菌株,可以作为蒽降解菌分离的混合 菌液。H3对于荧蒽的降解在5 d就能达到99%不仅 说明存在高效降解荧蒽的菌株,同时也说明了微生 物共代谢机理在多环芳烃降解中的体现,即在有其 他碳源和能源存在的条件下,微生物酶活性增强, 降解非生长基质的效率提高。称为共代谢作用L8j。 从图5中可以看出,H3对于苯并【a】芘的降解 率为27%,H14对于苯并[a】芘的降解率为1 1%。苯 并[a]芘为5环的多环芳烃,微生物对其的代谢基本 为共代谢,而且很难降解。沈德中研究表明,微生 物降解PAHs的难易程度取决于其化学结构的复杂 性和降解酶的适应程度 j。另外,影响微生物降解 PAHs的因素还有温度、盐度、pH值、通气状况、 营养盐和PAHs浓度等。巩宗强等报道,向土壤中 加人多环芳烃的代谢中间产物水杨酸等有机物,能 提高微生物酶的活性,促进芘共代谢降解过程的进 行,此外,营养物质的加入对提高共代谢率也是很 重要的。共代谢作为一种代谢机制,不仅有助于更 加准确地认识环境中存在共代谢情况下的生物降 解,而且为寻求生物降解技术提供了新思路【lo。…。 为了能筛选到高效降解多环芳烃的菌株,我们 根据颜色变化和色谱数据选取了N2、N3、Nl4、 NI6、Y2、Y11、Y12、H2(Y+B) H3(Y+B)、H2(N+Y)、 图6富集液N16 Fig.6 The mixed culture N16 图7 LD29菌藩形态 Fig.7 LD29 Colony mooholo ̄ H3(N+Y)、H2、H3、H14共14瓶富集液作为混合 菌进行分离,以期能分离出能够高效降解多环芳烃 的纯菌。最终,我们筛选到一株能够高效降解蒽、 菲、芘、荧蒽的菌株,编号LD29,来自土样编号 为l6,富集液编号为N16。富集液颜色见图6,巧 yanoikuyae LD29 o用GenBank Blast软件进行序列 相似性比较,结果显示菌株LD29的16SrDNA序列 与Sphingomonas yanoikuyae B1相似性99%【J ,与 Uncultured Sphingobium sp.clone GI5・007一A08相 合的是,与LD31来自于同一土样。该土样中有机 质、总磷、总钾、总氮质量分数分别为29.4 g・k譬~、 0.54 g‘kg~、0.01 g。kg~、0.5 g。kg~,pH 8.12,电导 率0.14ms・cm- ,含水率0.86%。 2.3菌株LD29的形态观察 LD29在30℃恒温培养箱培养,在牛肉膏平板 上,第二天就能看到淡黄色的针尖大小的菌落。呈 规则圆形,表面湿润、光滑、突起,边缘整齐,不 透明,质地粘稠(见图7)。 2.4分离菌株LD29的1 6SrDNA序列分析 序列测定得到1 365bp的1 6SrDNA部分序列, 鉴定结果为矢野12I鞘氨醇杆菌LD29(Sphingobium 似性99%【I川。基于16SrDNA的系统的构建发育树 见图8,电境图片见图9。目前对于矢野口鞘氨醇 杆菌对于多环芳烃降解的研究较少。有研究表明 Sphingobium yanoikuyae B1能够降解多种多环芳 烃,该菌株的存在会促进受污染土壤中其他微生物 的生长,与其他微生物存在生态位的竞争【1刚。 2.5菌株LD29的保藏 取单菌落在平板上划线,30℃培养,待长出菌 落将培养吼用封口膜封住,倒置于4℃冰箱,可存 放1个月。挑取单菌落用接种环以无菌操作在斜面 上作划线接种。置30℃恒温箱中培养72 h。保藏斜 面长好后,直接放入4℃的冰箱中保藏。这种方法 般可保藏3 ̄6个月。无菌操作下将5 mL石蜡油 加入到培养好的菌种上面,石蜡油封存以后,同样 一刘芳等:水一硅油双相体系对多环芳烃降解菌的筛选及鉴定 Spbingomonas sp.PF-D Sphin¥omontsyanoihuy'ao(AF331661.1) Sphingobiumymm//myae ̄train BF・18 LD29 S#ingomon ̄sp。SZL-I ingomonas sp.ZnH一1 咖 |l,an龄sp.PF-K 劬h他睁6 哪对 。 c(AB109749.I) 衄窖伽0n越¥p.RF-12 SphingoMumyanoilmyaestrain XJ Sphingomonas sp.PH-07 图8基于16SrDNA序列构建的菌株LD29的系统发育树 Fig.8 Phytogenetic tree based on the 1 6SrDNA sequence of strain LD29 A B 图9 LD29的电镜照片(A:放大5 000倍;B:放大10 000倍) Fig.9 Scanning and rtansmission electron micrographs ofSphingobiumyanoikuyae LD29(A:magniifcation,x5 000;B:magniifcation,×10 000 放入4℃冰箱中保存。这种方法保藏期一般为1~2 a。 为使其保持高效降解多环芳烃的特性,同时采 用以荧蒽为唯一碳源的无机盐液体培养基保存。实 验步骤为:取1 mL菌液,加到30 mL含荧蒽(1O0 mg・L。)的无机盐培养基中,摇瓶培养3 ̄4天后, [a]芘为碳源的无机盐液体培养基保存。实验步骤同 LD29菌株的保存。 保藏于4℃冰箱中。2~3个月转接一次。 2.6 蒽、荧蒽、苯并[a】芘降解菌(混合菌)的 筛选 实验发现,富集液Y12对于5种多环芳烃的降 解效果同样很明显,但遗憾的是,我们未能从中分 离出能够降解多环芳烃的纯菌,分离出的纯菌均没 有降解效果。我们推断,可能高效降解菌株为不可 培养微生物,也可能只有菌株一起存在才有降解效 3结论 (1)主要选用水一硅油双相体系驯化筛选出能够 高效降解多环芳烃的优势菌株。筛选体系为:50 mL 无机盐溶液+10 mL硅油。富集过程中,有的富集 液颜色呈红色,有的呈黄色,对其中有颜色变化的 l4瓶富集液进行液相色谱的定量测定。结果表明: 对于蒽的降解率为45%;对于荧蒽的降解率最低为 32%和38%;对于荧蒽的降解率最高为99%,几乎 全部降解。对于苯并【a]芘的降解率为27%。 (2)筛选到一株能够高效降解蒽、菲、芘、荧 蒽的菌株,编号LD29,来自土样编号为l6,富集 液编号为N16。与LD3l来自于同一土样。序列测 果。对于Y12的保存,我们采用以蒽、荧蒽、苯并 l892 生态环境学报第l9卷第8期(2010年8月) 定得到1365bp的16SrDNA部分序列,鉴定结果为 矢野口鞘氨醇杆菌LD29(Sphingobium yanoikuya LD29 o YANG Zhanwen,Advances of the degradation of PAHs in soils[J]. Shandong Chemical Industry,2008,37(1):30.33. [7]张从,沈德中,韩清鹏,等.水一硅油双相系统筛选分离多环芳烃 降解菌【J1l环境科学学报,2002,22(1):126.128. ZHANG Cong,SHEN Dezhong,HAN Qingpeng,et a1.Selecting and separating microorganisms of degrading PAHs in the water-silicon oil (3)富集液Y12对于5种多环芳烃的降解效果 同样很明显,但未能分离出能高效降解多环芳烃的 纯菌 参考文献: l1】孟范平.土壤的PAHs污染及其生物治理技术进展【J1.土壤学进展, 1995,23(1):32—42. MENG Fanping.Progress of soil contamination and its bio.treatment biphasic system[J].Acta Science Circumstantiae,2002,22(1): 126—128. [8]GRIFOLL M,SELIFONOV S A,GATLIN C、‘et a1.Actions of a versatile fluorene—degrading bacterial isolate on polycyclie aromatic compounds[J].Applied Environ Microbiol,1995,61(10):3711—3723. [9】沈德中.污染环境的生物修复[M].北京:化学工业出版社,2002: 18一l24. technology[J]Progress in Soil Science,1995,23(1):32—42. [2]姜永海,韦尚正,席北斗,等.PAHs在我国土壤中的污染现状及其 研究进展[J]_生态环境学报,2009,18(3):1176.1181 JIANG Yongbai,WEI Shangzheng,XI Beidou,et al Polycyclic aro— SHEN Dezhong The Bio—remediation of Pollutant Environment[M]. Beijing:Chemical Industry Press,2002:18—124. [1o】巩宗强,李培军,王新.芘在土壤中的共代谢降解研究【J].应用生 态学报,2001,12(3):447.450. matic hydro carbons(PAHs)pollution in soils in China:recent ad- vances and future prospects[J].Ecology and Environmental Sciences, 2009,18(3):I176—1181 GONG Zongqiang,Li Pe ̄un,Wang Xin Co-metabolic degradation of pyrene in soil[J].Chinese Journal of Applied Ecology,2010,l2(3): 447.450. [3]BITZU U The biodegradation of mixtures of organic solvents by mixed monocultures bacterial[J].Biotechnol Bioeng,1991,37(1 1): 1037.1042. [11]宋雪英,李昕馨,伦小文,等.张士灌区多环芳烃污染土壤的植物 修复[J].生态环境学报,2009,18(2):531—534. SONG Xueying,LI Xinxin,Lun Xiaowen,et a1.Phytoremediation of polycyclic aromatic hydrocarbon contaminated farmlnd soial in [4] 陶雪琴,卢佳宁,易筱筠,等.菲高效降解菌的筛选及其降解中间 产物分析[J].农业环境科学学报,2006,25(1):190.195 TAO Xueqin,LU Jianing,YI Xiaoyun,et a1.Isolation of Phenan— threne—degrading Microorganisms and Analysis of metabolites of Zhangshi wastewater img ̄ion area[J].Ecology and Environmnet, 2009,l8(2):53 1-534. Phenanthrene[J].Journal of Agro・environment science,2006,25(1): 190.195. [12】WANG Y LAU P C.Sequence and expression of all isocirtate dehy— drogenase—encoding gene from a polycyclic aromatic hydrocarbon [5】侯树字,张清敏,余海晨,等.多环芳烃芘高效降解菌的筛选及其 降解性能的研究fJ].南开大学学报:自然科学版,2006,39(2): 71.74. oxidizer,Sphingomonas yanoikuyae B1[J】.Gene,1996,168(1):15-21 [13】LADUCMT,OSMAN S,VAISHAMPAYAN P,et a1.Comprehensive census of bacteria in clean rooms by using DNA microarray nd claon— HOU Shuyu,ZHANG Qingmin,YU Haichen,et a1.Optimized culti— vation ofhigh・-eficifent degradation bacterial strains and their degrada—- ing methods[J]Applied Environmental Microbiology,2009,75(20): 6559.6567. tion ability towards Pyrene[J].Acta Scientiarum Naturalium Univer- sity Nankaiensis,2006,39(2):71-74 【14】CUNLIFFEM,KERTESZMA.Effect ofSphingobiumyanoikuyaeBI inoculation on bacterialcommunity dynamics and polycyclic aromatic [6】杨占文.土壤中多环芳烃菲和芘降解的研究进展Ⅲ2008,37(1):30-33. L“东化1二, hydrocarbon degradation in aged and freshly PAH—contaminated soils[J]Environmental Pollution,2006,144(1):228-237. The screening and characterization of PAHs—degrading strains by water-silicone oil system LIU Fang,LIANG Jinsong,LI Ji College ofResources and Environmental Sciences,ChinaAgricultural University,Beijing 100193,China Abstract:Screening of PAils—degrading strain by using water—silicone oil biphasic system:50 mL MSM solution+1 0 mL silicone oil.The biodegradation of Anthracene is 45%,fluoranthene is 99%,benzo[a]pyrene is 27%,by enrichment broth.We got a high bio— degradation strain Sphingobium yanoikuyae LD29,an enrichment broth has the high biodegradation capacity also. Key words:water-silicone oil;PAHs;degradation;screening
因篇幅问题不能全部显示,请点此查看更多更全内容