湖北省高校档次分层清晰，综合实力与学科特色差异显著，可划分为以下四个梯队：
第一梯队：顶尖985高校。
武汉大学、华中科技大学作为湖北省仅有的两所985工程大学，综合实力稳居全国前列。武汉大学学科门类齐全，在人文社科、理学、医学等领域优势突出，第五轮学科评估中斩获32个A级学科（含6个A+）；华中科技大学以工科见长，机械工程、光学工程、生物医学工程等学科实力强劲，第五轮学科评估中取得22个A级学科（含5个A+）。两校在科研平台、师资力量、国际声誉等方面均处于国内领先水平，是湖北省高等教育的“双子星”。
第二梯队：强势211高校。
武汉理工大学、华中师范大学、中南财经政法大学、华中农业大学、中国地质大学（武汉）等5所211工程大学构成第二梯队。武汉理工大学材料科学与工程学科全国顶尖，机械工程、交通运输工程等学科实力突出；华中师范大学作为教育部直属六所师范院校之一，教育学、心理学等学科优势显著；中南财经政法大学应用经济学、法学等学科实力强劲；华中农业大学农学类学科实力雄厚，第四轮学科评估中斩获7个A级学科；中国地质大学（武汉）地质学、地质资源与地质工程等学科全国领先。
第三梯队：省属重点及特色高校。
武汉科技大学、湖北大学、三峡大学、长江大学等省属重点高校构成第三梯队。武汉科技大学材料科学与工程、机械工程等学科实力突出；湖北大学经济学、生物学等学科发展迅速；三峡大学电气工程、水利工程等学科特色鲜明；长江大学石油与天然气工程、地质资源与地质工程等学科优势明显。这些高校在学科建设、人才培养等方面各具特色，是湖北省高等教育的重要支撑。
第四梯队：应用型及专科院校。
武昌首义学院、文华学院等民办高校及武汉职业技术学院、襄阳职业技术学院等专科院校构成第四梯队。这些院校注重应用型人才培养，专业设置紧密对接地方产业需求，为区域经济社会发展提供了大量技术技能型人才。